Pues hay infinidad de técnicas para hacer esto…
Para mí la que ofrece mejores resultados es la siguiente y por cierto, lo mismo os sirve para quitar los ojos rojos como para cambiarlos a otro color. El procedimiento es siempre el mismo:
1) Tenéis que desaturar la parte de la pupila que esta roja. Para eso tenéis que seleccionar la pupila. Coged la herramienta marco elíptico y crear una selección circular alrededor de la pupila. 1ª columna, 1ª fila de la ventana de herramientas. No más que eso. Podéis usar el comando transformar selección para adaptar mejor la selección al ojo también…
Os pongo un ejemplo hecho por mí a todo correr por si os ayuda más…

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